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PRACE Workshop: HPC code optimisation workshop
by Weinberg, Volker April 25, 2019

April 25, 2019

Dear HPC users of LRZ, There are still some places free for the upcoming PRACE "HPC code optimisation workshop" at LRZ. Date: Monday, May 20 - Wednesday, May 22, 2019, 9:00-17:00 Lecturers: Dr. Fabio Baruffa (Intel), Dr. Mathias Gerald (LRZ), Dr. Luigi Iapichino (LRZ) Further Details and Registration: https://events.prace-ri.eu/event/872/ Registration deadline: 6 May 2019 Location: LRZ Building, University campus Garching near Munich, Germany In the ever-growing complexity of computer architectures, code optimization has become the main route to keep pace with hardware advancements and effectively make use of current and upcoming High Performance Computing systems. Have you ever asked yourself: * Where does the performance of my application lay? * What is the maximum speed-up achievable on the architecture I am using? * Is my implementation matching the HPC objectives? In this workshop, experts from LRZ and Intel will answer these questions and provide a unique opportunity to learn techniques, methods and solutions on how to improve code, how to enable the new hardware features and how to use the roofline model to visualize the potential benefits of an optimization process. We will begin with a description of the latest micro-processor architectures and how the developers can efficiently use modern HPC hardware, in particular the vector units via SIMD programming and AVX-512 optimization and the memory hierarchy. The attendees are then conducted along the optimization process by means of hands-on exercises and learn how to enable vectorization using simple pragmas and more effective techniques, like changing data layout and alignment. The work is guided by the hints from the Intel® compiler reports, and using Intel® Advisor. NEW: this year the workshop will consist of three days. We will dedicate most of the third day to the Intel Math Kernel Library (MKL), in order to show how to gain performance through the use of libraries. We provide also an N-body code, to support the described optimization solutions with practical hands-on. The course is a PRACE training event. Further upcoming courses by LRZ Introduction to Intel FPGA Programming Models<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-05-21_hfpg1s19/> Tuesday, May 21, 2019, 09:00-17:00 PRACE Course: Deep Learning and GPU programming workshop<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-06-03_hdlw1s19/> Monday, June 3 - Thursday, June 6, 2019, 9:00-17:00 Advanced C++ with Focus on Software Engineering<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-06-12_hcpa1s19/> Wednesday, June 12 - Friday, June 14, 2019, 9:00 - 17:00 Deep Learning and GPU programming using OpenACC @ HLRS Stuttgart<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-07-15_hdlw2s19/> Monday, July 15 - Wednesday, July 17, 2019, 9:00-17:00 Introduction to ANSYS Fluid Dynamics (CFX, Fluent) on LRZ HPC Systems<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-09-02_hcfd2s19/> Monday, September 2 - Friday, September 6, 2019, 09:00-17:00 PRACE Course: Advanced Fortran Topics<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-09-09_hftn1s19/> Monday, September 9 - Friday, September 13, 2019, 9:00-18:00 Compact Course: Iterative Linear Solvers and Parallelization<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-09-16_hpar1s19/> Monday, September 16 08:30 - Friday, September 20, 2019, 15:30 Introduction to Semantic Patching of C programs with Coccinelle<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-10-08_hspc1w19/> Tuesday, October 8, 2019, 10:00 - 17:00 Advanced C++ with Focus on Software Engineering<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-11-20_hcpa1w19/> Wednesday, November 20 - Friday, November 22, 2019, 9:00 - 17:00 C++ Language for Beginners<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-11-25_hcpb1w19/> Monday, November 25 - Friday, November 29, 2019, 9:00 - 17:00 Information on further HPC courses * by LRZ: http://www.lrz.de/services/compute/courses/ * by the Gauss Centre of Supercomputing (GCS): http://www.gauss-centre.eu/training * by German Centres (collected by the Gauß-Allianz): https://hpc-calendar.gauss-allianz.de/ * by the Partnership for Advanced Computing in Europe (PRACE): http://www.training.prace-ri.eu/ Please also pass this course announcement to other interested colleagues. Kind regards, Volker Weinberg -- Dr. Volker Weinberg Leibniz Supercomputing Centre of the Bavarian Academy of Sciences and Humanities - HPC Systems and Services - email: weinberg(a)lrz.de<mailto:weinberg@lrz.de> address: Boltzmannstr. 1 - D-85748 Garching bei Muenchen room: E.1.016 phone: +49 (89) 35831-8863

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LRZ Stellenausschreibungen
by Major, Martin April 12, 2019

April 12, 2019

Zum nächstmöglichen Zeitpunkt suchen wir eine/n: Mitarbeiter/in (m/w/d) für den Betrieb und das Management von Netzkomponenten Das LRZ betreibt das Münchner Wissenschaftsnetz (MWN) und versorgt damit mehr als 200.000 Endgeräte in Universitäten und Forschungseinrichtungen im Großraum München mit Netzdiensten. Zu dieser Infrastruktur zählen auch rund 2.000 managebare Layer 2 Switches. Für das Management (Konfiguration, Betrieb, Fehlersuche, Monitoring, etc.) dieser Geräte suchen wir eine/n Mitarbeiter/in. Wir sind bestrebt das Management der Switches stärker zu automatisieren. In diesen Bereichen bringen Sie Ihre Expertise ein. Aufgaben: * Betrieb und Management der Switches im Münchner Wissenschaftsnetzes * Weiterentwicklung und Automatisierung der Betriebs- und Managementumgebung * Dokumentation der Infrastruktur Zur Stellenausschreibung <https://www.lrz.de/wir/stellen/2019-04_netb/> . _____ Wir suchen eine Studentische Hilfskraft (m/w/d) - Automatisierung im Software Engineering Das derzeit am Leibniz-Rechenzentrum laufende Forschungsprojekt CoCoReCS beschäftigt sich u.a. mit Fragen der Reproduzierbarkeit von Simulationsergebnissen auf HPC-Plattformen sowie der nachhaltigen Softwareentwicklung. Die praktischen Arbeiten stützen sich sowohl auf Standardtools wie Versionsverwaltung (z.B. gitlab) und Integration (z.B. Travis CI, Jenkins), aber auch spezielleren Tools aus dem Supercomputingbereich (Paketmanager Spack). In einer ersten Phase soll eine moderne, auf den HPC-Bereich abgestimmte Entwicklungspipeline aufgesetzt werden, deren Wirksamkeit anhand einer Testapplikation (SeisSol) überprüft und dokumentiert wird. Diese Ausschreibung wendet sich an engagierte Studierende, welche Interesse an der Gestaltung von automatisierten Build- und Softwarebereitstellungs-Prozessen haben und diese in einer professionellen IT-Landschaft implementieren möchten. Das Forschungsprojekt erlaubt diverse Freiräume und Gestaltungsmöglichkeiten bezüglich der Lösungswege. zur Stellenausschreibung <https://www.lrz.de/wir/stellen/2019-04_shk-se/>

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Stellenangebote: ITSM-Tool-Developer (m/w/d) || Content Writer (m/w/d)
by Major, Martin March 29, 2019

March 29, 2019

Für Weiterentwicklung und Administration der Tool-Unterstützung unserer Prozesse im IT-Service-Management (ITSM) sowie Grundlagenaufgaben bei der Abbildung dieser und weiterer Prozesse in Tools suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine/n Developer (m/w/d) für IT-Service Management Tools Aufgaben: * Administrative Betreuung sowie Weiterentwicklung unserer ITSM-Softwarelösungen * Entwicklung und Deployment von Erweiterungen * Beratung und Unterstützung der Prozessteams und Fachabteilungen hinsichtlich Automatisierungsmöglichkeiten Zur Stellenausschreibung <https://www.lrz.de/wir/stellen/2019-03_iet/> . _____ Zum nächstmöglichen Zeitpunkt suchen wir im Rahmen der Elternzeitvertretung in Teilzeit eine/n: Content Writer/Manager (m/w/d) Das bringen Sie mit: * Sie lieben das Schreiben und Geschichten erzählen. * Sie haben ein ausgeprägtes Interesse für Technikthemen wie Cloud Computing, High Performance Computing, künstliche Intelligenz, Big Data und mehr sowie für Wissenschaftsthemen. * Sie haben das Talent, komplexe Themen für unterschiedliche Zielgruppen auch weniger technik-affine Leser zugänglich zu machen. * Sie haben eine Liebe zum Detail gepaart mit einer gesunden Portion Pragmatismus * Sie sind in der Lage, selbstständig zu arbeiten und sich in einem dynamischen Umfeld zurechtzufinden. * Sie haben hervorragende Deutsch- und Englischkenntnisse in Wort und Schrift * Sie haben einen Bachelor- oder Master-Abschluss und verfügen über zwei bis drei Jahre Berufserfahrung im Kommunikationsbereich. Zur Stellenausschreibung <https://www.lrz.de/wir/stellen/2019-03_pr/> .

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ISP/TSM Server Softwarewartung am Donnerstag dem 04.04.2019
by Bublak, Dominik March 28, 2019

March 28, 2019

Sehr geehrte Damen und Herren, wegen der Behebung diverser Softwareprobleme sind ALLE ISP/TSM Server am Donnerstag dem 04.04.2019 zwischen 7:00 und 17:00 ganztägig außer Betrieb. In diesem Wartungszeitraum können keine Daten gesichert/archiviert werden und es können keine Daten zurückgeholt werden. SuperMUC Archive is affected by this maintenance Mit freundlichen Grüßen, Ihr LRZ ABS Team

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ISP/TSM Server Softwarewartung am 03.04.2019
by Bublak, Dominik March 28, 2019

March 28, 2019

Sehr geehrte Damen und Herren, wegen des Updates eines ISP/TSM Servers ist am Mittwoch dem 03.04.2019 zwischen 10:00 und 15:00 für ca. 4 Stunden mit Einschränkungen an den unten aufgelisteten ISP Servern zu rechnen. In diesem Wartungszeitraum können keine Daten zurückgeholt werden. ISP/TSM Server: S17, S19, S20, S21, S22, S24, S25, S27, S28, S30 SuperMUC Archive is NOT affected by this maintenance Mit freundlichen Grüßen, Ihr LRZ ABS Team

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ISP/TSM Server Softwarewartung am 05.04.2019
by Bublak, Dominik March 28, 2019

March 28, 2019

Sehr geehrte Damen und Herren, wegen der Behebung diverser Softwareprobleme sind ALLE ISP/TSM Server am Donnerstag dem 05.04.2019 zwischen 7:00 und 17:00 ganztägig außer Betrieb. In diesem Wartungszeitraum können keine Daten gesichert/archiviert werden und es können keine Daten zurückgeholt werden. SuperMUC Archive is affected by this maintenance Mit freundlichen Grüßen, Ihr LRZ ABS Team

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Semantic Patching of C programs with Coccinelle / Training on data analytics, big data and machine learning workflows
by Weinberg, Volker March 19, 2019

March 19, 2019

Dear users of LRZ, We are pleased to announce that the Leibniz Supercomputing Centre will offer a new course "Introduction to Semantic Patching of C programs with Coccinelle" for advanced C/C++ programmers. Date & Location Thursday, April 4, 2019, 10:00 - 17:00 Leibniz Supercomputing Centre (LRZ) of the Bavarian Academy of Sciences and Humanities, Garching near Munich, Boltzmannstr. 1, Kursraum 2, H.U.010 Registration deadline: March 22, 2019 Course Description The maintenance of a large software project can be very demanding. External factors like evolving third-party software library APIs, or constantly changing hardware platforms might require significant code adaptions for the code to run efficiently, or to run at all. Failure in coping with this can lead to obsolescence, loss of performance, incompatibility, vendor lock-in, bugs. Have you ever wondered how to detect and manipulate specified classes of C code constructs, be it for code analysis, or better, to restructure an arbitrarily large codebase according to a specified, non-trivial `pattern', without writing a C compiler? In this training we introduce you to a tool to do exactly this: match and restructure C codebases in a programmatic, formal way. The training will also show how to analyze code looking for interesting patterns (e.g. bugs), integrate with your Python scripts to achieve the custom transformations you need, and leverage Coccinelle's limited C++ support. Special attention will be on performance-oriented transformations in HPC. After this training, you shall be able to write your own code transformations, be it for a refactoring, performance improvement, paving the way to an experimental fork, or for debugging and further analysis. Teacher Dr. Michele Martone (LRZ) Registration and further information https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-04_hspc1s19/ Training on data analytics, big data and machine learning workflows at LRZ In addition to supporting traditional HPC applications, the Leibniz Supercomputing Centre (LRZ) is offering systems and services to address the increasing demand of data analytics, big data and machine learning workflows. In a series of trainings, we will provide introductory courses for researchers and students who want to utilize LRZ resources for tasks of this nature. The "opening session" on Tuesday, April 9th will provide an "Introduction to the LRZ Supercomputing & Machine Learning Infrastructure". Attending this full day course will give you an overview of the high performance computing hardware and software services available at LRZ and you will learn how to utilize these systems, focusing on different machine learning tools and applications. For further details and registration, please see https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-09_hsmi1s19/ A follow-up training on Wednesday, April 10th will take a deep-dive into "Using R at LRZ". This full day workshop will illustrate the different possibilities of utilizing R for data analytics and machine learning tasks on various LRZ systems by providing guidelines and best practice examples. For further details and registration, please see https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-10_hurl1s19/ On Thursday, April 11th an Intel Artificial Intelligence Workshop will highlight the usage of Intel's optimized performance libraries underneath popular machine learning frameworks. The workshop includes hands-on sessions around classical machine learning as well as deep learning on HPC systems. Besides introducing the transparent usage of performance libraries, the focus will be to empower participants to scale their deep learning (TensorFlow) application training on distributed HPC systems. For further details and registration, please see https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-11_hiai1s19/ Finally, on Friday, April 12th we will offer a "Using Python at LRZ" workshop. In this refresher course, different Python topics of interest to data analytics/machine learning practitioners and distinctive use cases of high performance computing environments will be covered. For further details and registration, please see https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-12_hupl1s19/ If you have any questions regarding these trainings prior to registration, feel free to contact Dr. Johannes Albert-von der Gönna (johannes.albert-vondergoenna(a)lrz.de<mailto:johannes.albert-vondergoenna@lrz.de>). Further upcoming courses Deep Learning and GPU programming using OpenACC @ VSC Vienna<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-03-27_hdlw2w18/> Wednesday, March 27 - Friday, March 29, 2019, 9:00-17:00 Introduction to Semantic Patching of C programs with Coccinelle<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-04_hspc1s19/> Thursday, April 4, 2019, 10:00 - 17:00 Introduction to ANSYS Fluid Dynamics (CFX, Fluent) on LRZ HPC Systems<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-08_hcfd1s19/> Monday, April 8 - Friday, April 12, 2019, 09:00-17:00 Introduction to the LRZ Supercomputing & Machine Learning Infrastructure<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-09_hsmi1s19/> Tuesday, April 9, 2019, 9:00-17:00 Using R at LRZ<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-10_hurl1s19/> Wednesday, April 10, 2019, 9:00-17:00 Intel Artificial Intelligence Workshop<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-11_hiai1s19/> Thursday, April 11, 2019, 9:00-17:00 Using Python at LRZ<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-04-12_hupl1s19/> Friday, April 12, 2019, 10:00-15:00 PRACE Workshop: HPC code optimisation workshop<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-05-20_hcow1s19/> Monday, May 20 - Wednesday, May 22, 2019, 9:00-17:00 PRACE Course: Deep Learning and GPU programming workshop<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-06-03_hdlw1s19/> Monday, June 3 - Thursday, June 6, 2019, 9:00-17:00 Advanced C++ with Focus on Software Engineering<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-06-12_hcpa1s19/> Wednesday, June 12 - Friday, June 14, 2019, 9:00 - 17:00 Deep Learning and GPU programming using OpenACC @ HLRS Stuttgart<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-07-15_hdlw2s19/> Monday, July 15 - Wednesday, July 17, 2019, 9:00-17:00 Introduction to ANSYS Fluid Dynamics (CFX, Fluent) on LRZ HPC Systems<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-09-02_hcfd2s19/> Monday, September 2 - Friday, September 6, 2019, 09:00-17:00 Advanced C++ with Focus on Software Engineering<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-11-20_hcpa1w19/> Wednesday, November 20 - Friday, November 22, 2019, 9:00 - 17:00 C++ Language for Beginners<https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-11-25_hcpb1w19/> Monday, November 25 - Friday, November 29, 2019, 9:00 - 17:00 Information on further HPC courses * by LRZ: http://www.lrz.de/services/compute/courses/ * by the Gauss Centre of Supercomputing (GCS): http://www.gauss-centre.eu/training * by German Centres (collected by the Gauß-Allianz): https://hpc-calendar.gauss-allianz.de/ * by the Partnership for Advanced Computing in Europe (PRACE): http://www.training.prace-ri.eu/ Please also pass this course announcement to other interested colleagues. Kind regards, Volker Weinberg -- Dr. Volker Weinberg Leibniz Supercomputing Centre of the Bavarian Academy of Sciences and Humanities - HPC Systems and Services - email: weinberg(a)lrz.de<mailto:weinberg@lrz.de> address: Boltzmannstr. 1 - D-85748 Garching bei Muenchen room: E.1.016 phone: +49 (89) 35831-8863

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ISP/TSM Server Softwarewartung
by Bublak, Dominik March 18, 2019

March 18, 2019

Sehr geehrte Damen und Herren, wegen der Behebung diverser Softwareprobleme sind die ISP/TSM Server S25, S381, S382, S24, S30, S18 und S29 am Dienstag den 26.03.2019 zwischen 7:00 und 14:00 für ca. vier Stunden außer Betrieb. In diesem Wartungszeitraum können keine Daten gesichert/archiviert werden und es können keine Daten zurückgeholt werden. SuperMUC Archive is NOT affected by this maintenance Mit freundlichen Grüßen, Ihr LRZ ABS Team

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Special Lecture: Intel Xeon Scalable (Skylake) Processor Architecture @ LRZ
by Weinberg, Volker March 18, 2019

March 18, 2019

Dear HPC users of LRZ, We would like to invite you to attend a special public lecture hosted by LRZ and PRACE, the Partnership for Advanced Computing in Europe. Andrey Semin (Intel Deutschland GmbH) will speak about the Intel Xeon Scalable (codenamed Skylake) processor that powers the new LRZ supercomputer SuperMUC-NG. The event flyer is available under https://www.lrz.de/services/compute/courses/2019-03-18_hppa1w18/Flyer-Semin… . Date: March 20, 2019 Time: 13:30 - 15:30 Location: LRZ, Hörsaal, H.E.009, Boltzmannstraße 1, 85748 Garching near Munich Title: Intel Xeon Scalable (Skylake) Processor Architecture Abstract: This special lecture will be devoted to the Intel Xeon Scalable (codenamed Skylake) processor that powers the brand new LRZ supercomputer: SuperMUC-NG. The presentation will cover details about the Skylake core microarchitecture and the Xeon uncore design. Additionally, the talk will provide details about the SuperMUC-NG compute node design and the fabric system architecture. Biography: Andrey Semin is a Principal Engineer at Intel in EMEA. He supports the leading European high-performance computing users, helping them to deploy new and innovative HPC solutions to grand-challenge problems. Andrey has been instrumental in developing HPC industry innovations delivering improvements in the energy efficiency from data center to applications. Andrey graduated from Moscow State University, specializing in possibility theory and its applications for physical experiment analysis. He is the author of over a dozen papers and patents in the area of application tuning and energy efficiency analysis, and recently Andrey co-authored a book "Optimizing HPC Applications with Intel Cluster Tools". In 2018 Andrey was honored with an Intel Achievement Award - the highest award given to an individual by Intel. This talk will be in English. Registration is not necessary. You are cordially invited and we hope that we can welcome you at LRZ for this interesting talk. Please also pass this lecture announcement to other interested colleagues. Kind regards, Volker Weinberg -- Dr. Volker Weinberg Leibniz Supercomputing Centre of the Bavarian Academy of Sciences and Humanities - HPC Systems and Services - email: weinberg(a)lrz.de<mailto:weinberg@lrz.de> address: Boltzmannstr. 1 - D-85748 Garching bei Muenchen room: E.1.016 phone: +49 (89) 35831-8863

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Stellenangebot: IT Architect & Linux Specialist (m/w/d)
by Major, Martin March 11, 2019

March 11, 2019

Zum nächstmöglichen Zeitpunkt suchen wir eine/n IT Architect & Linux Specialist (m/w/d) Das erwartet Dich bei uns: Du arbeitest in enger Kooperation mit den Projektleitern und den Softwareentwicklern des Münchner Digitalisierungszentrums sowie mit den Anwendungsbetreuern des Bibliotheksverbundes Bayern. Gemäß den Anforderungen unserer Kunden berätst Du bei der Konzeption von IT-Systemlandschaften und unterstützt die Implementierung und den Betrieb entsprechender Infrastrukturen. Du bist Ansprechpartner unserer Kunden und kanalisierst die Anliegen in das LRZ hinein und heraus. Du arbeitest agil und eigenständig in einem heterogenen Team, das sich zur automatisierten Orchestrierung von Server- und Speichersystemen bekennt. Zur Stellenausschreibung <https://www.lrz.de/wir/stellen/2019-03_bib/> .

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